母の失踪の謎を解くため、魔法学校で勉強を始めたユウ・ウェイは別世界に目を見開く。何度もつまずきながらも、素敵な仲間を得るとともに、陰謀の秘密を解き明かしながら、母を救い出す方法を見つけ出していく。
クリスタル・タウンでは、多くの人々が聖なる水晶と呼ばれる魔法の宝物を盗もうとしているが、何度も失敗している。その頃、幼いユウ・ウェイは祖父母を訪ねて母親と一緒に故郷に帰ってきていた。交通事故に遭ったYu Weiは、母親が引きずり出されるのを目撃するが、何もできずに意識を失ってしまう。
目を覚ましたユウ・ウェイは、自分がチェン・モーリーという少女に助けられ、現在病院で療養していることを知る。母を助けたい一心で、ユウ・ウェイは事故現場に戻る。しかし、母親は事故が起きたことを証明する手がかりとともに、この世から消えてしまったかのようだった。ユウウェイは初対面の祖母に助けを求めることにし、チェン・モーリーを連れてクリスタル・タウンへ向かう。
様々な経緯で偶然にも名門マーリン学園に入学した彼は、自分が聖なる水晶に選ばれて魔術師の道を歩んでいることを知る。その結果、ユウ・ウェイは悔しがり、さらにチェン・モーリーは彼の助手になることに!
