第2期中の2018年2月25日の放送終了時に、後期募集を行うことが発表されました。これにより、第3期がスタートします。
公式サイトでは、1stシーズンの手法を踏襲しつつ、事務所所属でもOKだった「1期生」とは異なり、他のアイドルグループオーディションと同様に「素人」（事務所に所属していない人）の応募資格に絞られたことが紹介されています。また、3月11日には「新生ラストアイドル」のメンバーが、セカンドシーズン最終回で12人になることが明らかになった。
なお、今回のサードシーズンから、テレビ朝日放送は時差のない遅いネットに移行している（30分遅れ）。
9月30日の放送で最終回を迎え、正式なメンバーが確定した。
2代目ラストアイドルが歌う曲は「愛しか吹いていない」。
