幕末の頃、檀野正三郎は藩の宰相・中根からある命令を受ける。7年前に妾の子を殺した罪で謹慎中の戸田秋谷を監視せよという命令である。秋谷は3年以内に切腹することになっている。そんな中、秋谷は先代大名から命じられた大名の家系図を本にする仕事をする。やがて檀野正三郎は、秋谷と戸田秋谷の妻・織江、そして娘の薫に心を動かされるようになる。特に、戸田秋谷の家系図作成への熱意と、織江の夫と娘への愛と信頼に、團野正三郎は心を動かされるのである。しかし、戸田秋谷が使用人の少年を殺害したとは考えにくい。團野正三郎は、7年前の事件を調査することにした。
~~ 葉室麟の小説「日暮の記」を映画化。